BIOLOGIA MOLEKULARNA 2

 0    171 fiche    chomikmimi
Télécharger mP3 Imprimer jouer consultez
 
question język polski réponse język polski
Białka, światło?
commencer à apprendre
Światło o długośi 280 nm
Absorpcja gdzie najwieksza
commencer à apprendre
dla nukleotydów
Absorpcja gdzie najmniejsza
commencer à apprendre
dla dsDNA
Od czego zależy współczynnik ekstyncji'?
commencer à apprendre
Od długości badanej cząsteczki
co znaczy hipochromizm
commencer à apprendre
mniej barwny
dsDNA o stęż 1mg/ml ile a?
commencer à apprendre
a260 = 20
RNA i ssDNA ile a?
commencer à apprendre
a260- 25
co ma wyższy współczynnik ekstynkcji, puryny czy pirymidyny?
commencer à apprendre
puryny
Topnienie (ogrzewanie) - absorbancja?
commencer à apprendre
40% wzrost absorbancji
Szybkie ochładzanie - absorbancja?
commencer à apprendre
Minimalny spadek absorbancji
Wolne ochładzanie - absorbancja?
commencer à apprendre
Absorbancja bez zmian
Wektor, jaka zdolność
commencer à apprendre
Zdolność do izolacji od gospodara i replikacji
Fag alfa, zdolność?
commencer à apprendre
Zdolność do klonowania większych fragmentów
h13 zdolność?
commencer à apprendre
zdolność do klonowanie fragmentów jednoniciowych
co to kosmid?
commencer à apprendre
plazmid + fag alfa
Episomalne plazmidy są wektorami dla?
commencer à apprendre
Są wektorami dla drożdzy
Plazmid Ti wektor dla?
commencer à apprendre
Roślin
Biblioteki DNA
commencer à apprendre
zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne
commencer à apprendre
analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne
commencer à apprendre
są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+, Rb2+
Transformanty, gdzie najpierw są przechowywane?
commencer à apprendre
w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja)
Gdzie po selekcji są przechowywane transformanty?
commencer à apprendre
Są zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy), tzw. zapas glicerolowy
Co robi fosfotaza alkaliczna?
commencer à apprendre
ten enzym usuwa reszty fosforanowe z 5'
co robi polimeraza DNA I?
commencer à apprendre
ten enzym odpowiada za syntezez nici z 5->3
co to Fragment klenowa?
commencer à apprendre
ten enzym to pochodna polimerazy DNA I, brak własciowsci egzonukleazy
Nukleaza fasoli mung co to
commencer à apprendre
ten enzym trawi jednoniciowe fragmenty naprzeciw pęknięcia nici
ODWROTNA TRANSKRYPTAZA
commencer à apprendre
Zależna od RNA, synteza DNA komplementarnego do RNA w kierunku 3->5 od startera z 3'OH
czego wymaga odwrotna transkryptaza?
commencer à apprendre
trifosforanów deoksyrybonukelozydów
co robi RNAza A?
commencer à apprendre
ten enzym trawi RNA
co robi RNAza H?
commencer à apprendre
ten enzym trawi RNA hybrydy DNA-RNA
Terminalna transferaza co robi
commencer à apprendre
ten eznym dodaje nukleotydy do końca 3' a jak GTP to powtaje ogon oligoG
A260/a280 = 1,8 a czystość dna
commencer à apprendre
Czyste DNA
a260/280 < 1,8 a czystosc DNA
commencer à apprendre
zanieszczone białkiem
a260/280 > 1,8 a czystosc DNA
commencer à apprendre
zanieszczyczone RNA
co to Wirowanie izopikniczne
commencer à apprendre
równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia wirowanie izopikniczne?
commencer à apprendre
Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Gęstość DNA w wirowaniu izopiknicznym?
commencer à apprendre
1,7g/cm3
Co robi RNA i białka w wirowaniu izopiknicznym?
commencer à apprendre
RNA w dół, białka flotują(unoszą się)
Jaki barwnik w elektroforezie?
commencer à apprendre
różowo/pomarańczowy bromek etydyyny
jak zachodzi elektroforeza
commencer à apprendre
od KATODY (-) do ANODY (+)
Od czego zależy szybkość migracji kolistego DNA w elektroforezie?
commencer à apprendre
od warunków
Napięcie w elektroforezie
commencer à apprendre
5-8 V/cm3
Gdzie najlepiej widoczna elektroforeza?
commencer à apprendre
w RNA
Jakie środowisko zachodzenia elektroforezy?
commencer à apprendre
W żelu agarozowym (bromek etydyny) lub poliakrydynowym (AgNO3/SYBR)
co to metoda gRTPCR?
commencer à apprendre
real time, analiza ilości produktów w czasie rzeczywistym
czego używa się w gRTPCR?
commencer à apprendre
SYBR
cechy SYBR
commencer à apprendre
nietoksyczny i silnie wiążacy DNA
Kiedy zachodzi analiza w gRTPCR?
commencer à apprendre
analiza w czasie trawienia
czego analiza w gRTPCR?
commencer à apprendre
Analiza polimorfizmu pojedynczych nukleotydów
Co jest znakowane w gRTPCR?
commencer à apprendre
nukleotydy i sondy
Elektroforeza mikrokapilarna
commencer à apprendre
z wykorzystaniem macierzy
Elektroforeza kapilarna
commencer à apprendre
w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, z cienkiej kapilarze kwarcowej
W żelu poliakrydynowym elektoforeza (PZ)
commencer à apprendre
5-1000 pz (gRTPCR)
w żelu agarozowym elektroforeza
commencer à apprendre
0,1 - 20 kpz
w polu pulsacyjnym elektroforeza
commencer à apprendre
20kpz - 10 Mpz, oddziela cząsteczki wielkości 100kpz
Choroba takahary, inna nazwa
commencer à apprendre
alaktazemia
jaki gen, choroba Takahary?
commencer à apprendre
Gen kontrolujący syntezę katalazy, krótkie ramie chromosomu 11 (11p13)
jak dziedziczona alaktazemia?
commencer à apprendre
autosomalnie recesywnie
Na czym polega alaktazemia?
commencer à apprendre
Redukcja aktywnośći katalazy
gdzie najczęściej alaktazemia?
commencer à apprendre
Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Objawy alaktazemii
commencer à apprendre
Owrzodzenie śluzówek jamy ustnej, podudzi, oraz wczesne wypadanie zębów
Cholinoesteraza
commencer à apprendre
gen na 3 chromosomie i tam mutacja
Wrażliwość na chlorek suksametonium, objawy?
commencer à apprendre
zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale też szybko zanika. (za objawy odpowiada hydroliza sukcynylocholiny)
za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialna jest?
commencer à apprendre
cholinoesteraza
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
commencer à apprendre
autosomalnie dominująco
Przez co wywoływana hipertermia złośliwa
commencer à apprendre
leki znieczulenia ogólnego: antystetyki wziewne, dożylne, leki zwiotczające, glikozydy naprastnicy
Objawy hipertemia złośliwa
commencer à apprendre
wzrasta napięcie mięsni prązkowanych, drzenie mięsniowe, pojawa się tachykardia i wzrost temperatury ciała(1 stopien w ciagu 5 min)
Mutacja genu 19q13.1
commencer à apprendre
Koduje receptor rianodynowy uwalniajacy wapń z retikulum do cytoplazmy ->hipertermia złośliwa
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
commencer à apprendre
autosomalnie dominująco
Alaktazemia jaki gen
commencer à apprendre
11p13
jak dziedziczona alaktazemia?
commencer à apprendre
autosomalna recesywna
Metaboizm alkoholu etylowego, jakie enzymy?
commencer à apprendre
Dehydrogenaza alkoholowa ADH i dehydrogenaza aldehydowa ALDH
gdzie dehydrogenaza alkoholowa ADH?
commencer à apprendre
chromosom 4
gdzie dehydrogenaza aldehydowa ALDH?
commencer à apprendre
1-chromosom 9, 2-chromosom 12
Porifiryny
commencer à apprendre
prekursory hemu i składniki enzymów
na jakie dzielimy porifiryny
commencer à apprendre
na wątrobowe i erytropoetyczne
Porfirie, na czym polega
commencer à apprendre
Deficyt enzymów biorących udział w przemianach porfiryn
Jak dziedziczone porfirie?
commencer à apprendre
Autosomalnie dominująco
Krzywica odporna na wit D3, jaki gen?
commencer à apprendre
gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowej, jaki chromosom
commencer à apprendre
chromosom X
niedobór alfa-1-antytrypsyny, jaki gen i chromosom
commencer à apprendre
Gen PI, chromosom 14
niedobór paraoksonazy, gen + chromosm
commencer à apprendre
gen PON1 na chromosomie 7 sprzeżony z genem CFTR
Hemochromatoza, jaki gen
commencer à apprendre
gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
hipolaktazja, jaki gen
commencer à apprendre
3 allele na chromosomie 3
fenyloketonuria, jaki gen
commencer à apprendre
12q24.1
Jak dziedziczona fenyloketonuria?
commencer à apprendre
autosomalnie recesywnie
Co wywołuje ostrą porfirie?
commencer à apprendre
Lek, infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizycnzy
Jakie leki wywołują ostrą porfifrie?
commencer à apprendre
barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanolu,
Kiedy forma enolowa?
commencer à apprendre
w pH zasadowym
Kiedy forma ketonowa?
commencer à apprendre
w ph obojętnym
Co to sonikacja?
commencer à apprendre
Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA
Do czego prowadzi sonikacja?
commencer à apprendre
Do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkośći
Podział zasad
commencer à apprendre
Puryny i pirymidyny
Puryny
commencer à apprendre
adenina i guanina (2 pierścienie)
Pirymidyny
commencer à apprendre
cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścien)
Co to liza alkaliczna?
commencer à apprendre
Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosowego DNA i innych
Plazmidy
commencer à apprendre
Autonomiczne, pozachromosome elementy genetyczne
W jakiej postaci występują Plazmidy?
commencer à apprendre
w postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
gdzie wystąpują Plazmidy?
commencer à apprendre
u prokariotów i niektórych eukariotów
Jaka zdolnosc maja plazmidy?
commencer à apprendre
Zdolność do trwałego utrzymywania się i replikowania w komórce
Plazmidy a chromosomy gospodarza
commencer à apprendre
Są odrębne od chromosomów gospodrza
Jaką struktuę tworzą plazmidy?
commencer à apprendre
CCC-DNA
co robi CCC-DNA?
commencer à apprendre
wykazuje negatywne superskręcenie
Jakie plazmidy nie tworzą struktury CCC-DNA?
commencer à apprendre
Plazmidy izolowane z hypertermofilnych Archaea, u których jest pozytywne superskręcenie cz. DNA
wielkość plazmidów
commencer à apprendre
od 1000 pz do 1,7 Mpz
Gdzie najmniejsze plazmidy?
commencer à apprendre
U Heamophilus somnus, Mycoplasma i Helicobacter pylori
Gdzie największe plazmidy?
commencer à apprendre
u Rhizobium
Gen kodujący białko (plazmidy)
commencer à apprendre
30 kDa - 1 kpzC
Co zawierają plazmidy?
commencer à apprendre
Region początku replikacji
Jakie geny często zawierają plazmidy?
commencer à apprendre
odporności, np. gen bla / ampr
Co robi gen bla/ampr?
commencer à apprendre
Koduje beta-laktamaze, która rozkłada antybiotyki penicylowe
NORTHERN BLOT
commencer à apprendre
dla transferu rozdzielonego elektroforetycznie DNA
SOUTHERNBLOT
commencer à apprendre
osmoza do wymuszenia węrdrówki soli z pociąganiem DNA ze sobą
WESTERN BLOT
commencer à apprendre
dla transferu białka
EASTERN BLOT
commencer à apprendre
dla transferu białek po ich rozdziale w elektroforezie dwukierunkowej
DNA/RNA w środowisku kwasowym
commencer à apprendre
hydroliza
DNA/RNA w środowisku lżej kwasowym (3-4)
commencer à apprendre
hydroliza wiązan glikozydowych, kwas apurynowy
DNA/RNA w środowisku zasadowym
commencer à apprendre
denaturacja (RNA i DNA), hydroliza (RNA, bo ma 2-OH')
Co jest bardziej podatne na hydrolize? DNA czy RNA?
commencer à apprendre
ZAWSZE RNA
Multipleks PCR
commencer à apprendre
ampliflikacja równoczesna
Nested-PCR
commencer à apprendre
wewnętrzna/gniazdowa, gdy mało matryc
RT-PCR
commencer à apprendre
przepisanie sekwencji z MRNA składającego się z samych eksonów na cDNA - stwierdzanie obecności określonych transkryptów
STS-PCR
commencer à apprendre
Umożliwia indentyfikację poszczególnych loci dzięki amplifikacji fragmentu DNA pomiędzy parą starterów o znanej sekwencji
STS – ile pz?
commencer à apprendre
200-300 pz
Zagęszczanie map genetycznych, jaka metoda
commencer à apprendre
STS-PCR
Poszukiwanie sprzężen z cechami genotypowymi, jaka metoda
commencer à apprendre
STS-PCR
do uporządkowania bibiloteki genomowej w KONTIGI, jaka metoda?
commencer à apprendre
STS-PCR
RACE-PCR
commencer à apprendre
szybka amplifikacja końców Cdna, poznanie dokładnej sekwencji jednego z końców
ASA=PASA=ASP=ARMS
commencer à apprendre
amplifikacja alleo-specyficzna, wykrywa polimorfizm alleli i mutacji punktowych
ASO
commencer à apprendre
połączenie hybrydyzacji i PCR
co robi sonda w ASO?
commencer à apprendre
sonda rozponzacje allel prawidłowy/zmutowany
OLA
commencer à apprendre
badanie ligacji oligonukleotydów, połączenie PCR i ligacji DNA
REP-PCR
commencer à apprendre
wykorzystanie sekwencji repetytywnych
AS-PCR
commencer à apprendre
asymetryczne PCR, amplifikowana tylko 1 nić, na 3' fluorochrom
I-PCR
commencer à apprendre
odwrócona PCR, DNA oskrzydla znana sekwencje
PCR in situ
commencer à apprendre
z udziałem znakowanych nukleotydów, czuła i kosztowna
RAPD-PCR
commencer à apprendre
losowa amplifikacja polimorficznego DNA, umożliwia jednoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
Jaka ilość DNA wyjściowego w RAPD-PCr?
commencer à apprendre
mała
W jakiej metodzie PCR wykyrywane loci mają dominujący charakter?
commencer à apprendre
w RAPD-PCR
W jakiej metodzie nie można odróżnić homozygot od heterozygot?
commencer à apprendre
w RAPD-PCR, bo wizualizacja tylko jednego z dwóch alleli
Badanie jakiego materiału jest zalecane przy RAPD-PCR?
commencer à apprendre
Haploidalnego materiału
W jakiej metodzie badanie zróżnicowania DNA jądrowego między osobnikami i populacjami?
commencer à apprendre
RAPD-PCR
Jaka metoda umożliwia szybkie określenie liczby chromatyny X i Y w jądrach interfazowych?
commencer à apprendre
FISH
FISH umożliwia zlokalizowanie jakich sekwencji DNA?
commencer à apprendre
nieswoistych sekwencji DNA bezporśrednio w materiale genetycznym
Jakie zmiany bada FISH?
commencer à apprendre
Zmiany ilościowe w liczbie i strukturze chromosomów
Metoda oparta na fish
commencer à apprendre
cytogenetyka interfazalna
Do czego hybrydyzacja typu northern?
commencer à apprendre
do analizy RNA i procesu transkrypcji poszczególnych genów
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji w badanych tkankach - jaka metoda
commencer à apprendre
Hybrydyzacja typu northern
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji na danym etapie rozwoju - jaka metoda?
commencer à apprendre
hybrydyzacja typu northern
Poznanie czego jest możliwe dzięki hybrydzacji typu northern?
commencer à apprendre
Poznanie długości RNA i intensywność jego transkrybcji
Hybrydyzacja RNA-DNA jaka metoda
commencer à apprendre
northern
Hybrydyzacja DNA-DNA jaka metoda
commencer à apprendre
southern
HGP
commencer à apprendre
projekt poznania ludzkiego genomu
knockout
commencer à apprendre
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego typu
genomika porównawcza
commencer à apprendre
porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika
commencer à apprendre
wiedza o zespolach bialek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika
commencer à apprendre
badanie regulacji ekspresji genów na poziome transkrypcji
gdzie znalezione enzymy restrykcyjne?
commencer à apprendre
jedynie w komórkach bakterii i sinic
Enzym restrykcyjny jakie sekwencje rozpoznaje?
commencer à apprendre
Speficzyne sekwencje dwuniciowego DNA o długości 4-8 par zasad
Aktywność STAR
commencer à apprendre
niespecyficznośćenzymów restrykcyjnych w niektórych warunkach
kiedy aktywność star?
commencer à apprendre
kiedy trawienie przeprowadza sięwinnych warunkach niż optymalnie
Enzym EcoRI a zmienione warunki
commencer à apprendre
zmienione warunki mogę uniemożliwić wykrycie struktury GAATTC, którą normalnie rozpoznaje
co to optymalne warunki trawienia
commencer à apprendre
odpowiednie Ph, stęzenie jonów magnezu
Co pozostawiją enzymy restrykcyjne?
commencer à apprendre
Końce tępe i lepkie w cząsteczce
Gdy obie nici rozcięte są naprzeciwko siebie równolegle, powstają
commencer à apprendre
tępe końce
Gdy jednoniciowe sekwencje wystepujace na obu koncach sa przeciete niesymetrycznie, powstaja
commencer à apprendre
lepkie konce
Restryktazy czworkowe
commencer à apprendre
rozpoznaja sekwencje DNA co 256pz
Restryktazy szostkowe
commencer à apprendre
Rozpoznaja sekwencje DNA co 4096 pz
Izoschizomery
commencer à apprendre
enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Egzonukleazy
commencer à apprendre
umożliwiaja odpowiednią modyfikacje koncow we fragmentach DNA
polimerazy
commencer à apprendre
odpowiedzialne za amplifikację odpowiednich odcinkow DNA

Vous devez vous connecter pour poster un commentaire.